258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0885 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
163 aa  326  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  72.55 
 
 
159 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  72.55 
 
 
159 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  72.55 
 
 
159 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  74.15 
 
 
165 aa  205  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  77.03 
 
 
152 aa  204  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  67.55 
 
 
158 aa  200  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  73.2 
 
 
156 aa  200  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  63.16 
 
 
157 aa  197  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  62.34 
 
 
156 aa  197  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  63.69 
 
 
169 aa  197  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  73.83 
 
 
152 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  73.97 
 
 
171 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  74.5 
 
 
156 aa  190  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  66.89 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  69.33 
 
 
160 aa  187  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1918  ribose 5-phosphate isomerase  68.24 
 
 
167 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4226  ribose 5-phosphate isomerase  67.57 
 
 
167 aa  184  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245693  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  57.62 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  54.04 
 
 
163 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0412  ribose 5-phosphate isomerase  53.42 
 
 
163 aa  174  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  57.14 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  54.86 
 
 
163 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.99 
 
 
152 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.75 
 
 
159 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.98 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.98 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.62 
 
 
157 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.33 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  46.94 
 
 
148 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  49.3 
 
 
145 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  44.08 
 
 
152 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  45.7 
 
 
149 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  43.42 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  46.31 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  43.42 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  43.84 
 
 
151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  43.84 
 
 
151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  43.84 
 
 
151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  44.97 
 
 
152 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  46.71 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  43.24 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  45.83 
 
 
148 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  44.22 
 
 
157 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  44.52 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.51 
 
 
149 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  47.69 
 
 
322 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  40.27 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  43.05 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  40.27 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  45.21 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  44.52 
 
 
158 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  40.4 
 
 
149 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  46 
 
 
153 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.33 
 
 
149 aa  111  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  40.65 
 
 
158 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44 
 
 
152 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  38 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.31 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.96 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.31 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.07 
 
 
149 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40 
 
 
148 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  38.1 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  38.82 
 
 
149 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  38.82 
 
 
149 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.74 
 
 
149 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  43.15 
 
 
149 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.08 
 
 
146 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.26 
 
 
149 aa  104  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  41.61 
 
 
181 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.93 
 
 
152 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  42.47 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  37.33 
 
 
148 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  39.86 
 
 
148 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.61 
 
 
148 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.41 
 
 
149 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.22 
 
 
149 aa  101  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  38.03 
 
 
148 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.78 
 
 
147 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
147 aa  99  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  42.64 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  37.75 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>