261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5329 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  85.23 
 
 
152 aa  265  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  85.91 
 
 
151 aa  265  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  85.91 
 
 
151 aa  265  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  80.92 
 
 
153 aa  251  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  64.43 
 
 
148 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  62.84 
 
 
145 aa  173  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  50.67 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  50.33 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.65 
 
 
157 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.76 
 
 
153 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  44.67 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.3 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  40.79 
 
 
157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  46.31 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.86 
 
 
149 aa  117  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  48.25 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.01 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.89 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  43.62 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  43.05 
 
 
163 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.62 
 
 
152 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  44.87 
 
 
157 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  47.26 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  40.76 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  46.04 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  42.36 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  43.54 
 
 
158 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  45.39 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  57.14 
 
 
163 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.67 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  44 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0412  ribose 5-phosphate isomerase  54.35 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  50.91 
 
 
152 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.14 
 
 
163 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.37 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.45 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  40.65 
 
 
149 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  40.65 
 
 
149 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  48.6 
 
 
169 aa  106  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.45 
 
 
152 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.72 
 
 
147 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.62 
 
 
149 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  42.25 
 
 
171 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4226  ribose 5-phosphate isomerase  55.81 
 
 
167 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245693  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  41.22 
 
 
156 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 
156 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  42.96 
 
 
151 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  42.96 
 
 
151 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1918  ribose 5-phosphate isomerase  55.81 
 
 
167 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  45.8 
 
 
322 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  42.96 
 
 
151 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  43.06 
 
 
156 aa  103  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  38.19 
 
 
156 aa  103  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  38.67 
 
 
149 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1864  ribose 5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  45 
 
 
156 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  47.12 
 
 
160 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  40.41 
 
 
158 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  40.13 
 
 
149 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  37.91 
 
 
149 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  52.22 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  39.46 
 
 
162 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  40.79 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.82 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  39.22 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  40.88 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  38.51 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  42.19 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  38.51 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.78 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  34.87 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.24 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  32.45 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  37.84 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  35.46 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.27 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  37.98 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  37.84 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.05 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  37.16 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.28 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  36.43 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>