259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1548 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
152 aa  299  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  76.51 
 
 
159 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  76.51 
 
 
159 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  76.51 
 
 
159 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  77.03 
 
 
163 aa  220  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  76.87 
 
 
160 aa  203  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  63.33 
 
 
156 aa  204  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  65.54 
 
 
156 aa  201  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  70.86 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  65.77 
 
 
157 aa  198  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  67.57 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  71.72 
 
 
165 aa  193  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  70.67 
 
 
152 aa  191  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0412  ribose 5-phosphate isomerase  59.35 
 
 
163 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  64 
 
 
169 aa  189  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  59.09 
 
 
163 aa  187  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4226  ribose 5-phosphate isomerase  67.35 
 
 
167 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245693  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  71.23 
 
 
171 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1918  ribose 5-phosphate isomerase  66.67 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  56.67 
 
 
153 aa  177  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  65.33 
 
 
156 aa  173  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  63.82 
 
 
156 aa  160  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  54.17 
 
 
163 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.3 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.64 
 
 
159 aa  133  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.21 
 
 
153 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.64 
 
 
149 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.58 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  47.65 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  46.98 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  46.98 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.69 
 
 
149 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  43.92 
 
 
149 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  43.71 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  42.67 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
148 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  44.83 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  45.33 
 
 
151 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  39.6 
 
 
149 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  46.21 
 
 
322 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  43.54 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.67 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.95 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  40.82 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  43.24 
 
 
149 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  40.67 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  40.67 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  40.67 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  40.67 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  40.67 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  45.58 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  42.28 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  42.57 
 
 
149 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  42.57 
 
 
149 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  42.57 
 
 
149 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.78 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.94 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  44.52 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  38.93 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.94 
 
 
149 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
147 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
147 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  38.67 
 
 
147 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  43.66 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.46 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.82 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  42.48 
 
 
181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  40.94 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 
148 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  41.1 
 
 
152 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  40.54 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  40.54 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  40.54 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.57 
 
 
157 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  36.91 
 
 
148 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.82 
 
 
148 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  40.77 
 
 
148 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  39.33 
 
 
152 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.74 
 
 
149 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  40.27 
 
 
152 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.62 
 
 
143 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  40.77 
 
 
148 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.77 
 
 
151 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  36.05 
 
 
149 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  36.05 
 
 
149 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  37.33 
 
 
149 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.54 
 
 
151 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.14 
 
 
147 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>