257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0881 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  76.55 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  76.55 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  76.55 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  74.15 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  72.3 
 
 		 158 aa  203  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  67.81 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  63.75 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  61.84 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  67.31 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1918  ribose 5-phosphate isomerase  64.81 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4226  ribose 5-phosphate isomerase  64.2 
 
 		 167 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245693  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  71.72 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  66.22 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  70.95 
 
 		 171 aa  186  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  58.67 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  56.95 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0412  ribose 5-phosphate isomerase  57.33 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  65.07 
 
 		 156 aa  173  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  64.38 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  66.22 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  52.74 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.37 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.98 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  45.86 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  48.7 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.3 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.31 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  46.98 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  46.31 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  44.3 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  44.3 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  44.3 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.59 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  45.22 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  46.26 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.62 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  41.83 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.54 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.31 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  41.83 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  43.54 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  42.07 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 322 aa  107  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  41.86 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  47.75 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  47.75 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  40 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  41.09 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  37.67 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  49.04 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  46.9 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  38.46 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  38.51 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  42.64 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  49.04 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.03 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.97 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.74 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  38.96 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  42.66 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  39.85 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  38.62 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.75 
 
 		 151 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  37.93 
 
 		 148 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  37.41 
 
 		 147 aa  97.1  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  37.4 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  37.4 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  42.4 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  36.3 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>