263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4652 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  88.28 
 
 
145 aa  259  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  64.43 
 
 
151 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  61.59 
 
 
151 aa  183  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  61.59 
 
 
151 aa  183  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  61.59 
 
 
152 aa  183  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  61.33 
 
 
153 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  52.98 
 
 
153 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  58.33 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  56.34 
 
 
157 aa  143  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  57.04 
 
 
149 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  52.38 
 
 
149 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  51.35 
 
 
152 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  52.94 
 
 
152 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.58 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  51.02 
 
 
152 aa  133  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  49.32 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  49.32 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  49.32 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  50.68 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  55.81 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  51.41 
 
 
148 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  48 
 
 
153 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  46.41 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.49 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  50.39 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  46.36 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  47.65 
 
 
158 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  47.97 
 
 
153 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  42 
 
 
157 aa  120  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.66 
 
 
163 aa  117  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  43.05 
 
 
158 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.71 
 
 
149 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  43.45 
 
 
159 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  43.45 
 
 
159 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  43.45 
 
 
159 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  45.07 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.77 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  43.62 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  45.83 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.76 
 
 
143 aa  114  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  42.95 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  41.29 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  46.21 
 
 
322 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  43.84 
 
 
156 aa  110  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.64 
 
 
149 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  44 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  43.75 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4226  ribose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 
167 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245693  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1918  ribose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 
167 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  43.33 
 
 
156 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  54.95 
 
 
163 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.46 
 
 
149 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0412  ribose 5-phosphate isomerase  39.87 
 
 
163 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  55.56 
 
 
165 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  44.96 
 
 
149 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  36.91 
 
 
148 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  45.67 
 
 
162 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  43.85 
 
 
149 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  44.96 
 
 
148 aa  103  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  38.31 
 
 
156 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  40.97 
 
 
152 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  43.85 
 
 
148 aa  103  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  38.06 
 
 
156 aa  103  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.08 
 
 
152 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.86 
 
 
142 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.6 
 
 
147 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  37.16 
 
 
152 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  35.57 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.31 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  41.54 
 
 
147 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  37.91 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  41.54 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  41.54 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  41.54 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  41.54 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  33.33 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  40.77 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  40.77 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  37.58 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.52 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.77 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
370 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.1 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  37.21 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>