More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2210 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2210  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
307 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3588  OmpA family protein  49.43 
 
 
306 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2912  OmpA/MotB domain-containing protein  51.95 
 
 
364 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.060006  normal  0.12537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2737  OmpA/MotB domain protein  35.69 
 
 
260 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.45 
 
 
271 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  32.9 
 
 
251 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  26.27 
 
 
261 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  26.12 
 
 
273 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  29.89 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  30.87 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
269 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  30.25 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  26.12 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  27.57 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  28.24 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  28.35 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  27.63 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  26.42 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  30.98 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 
257 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  29.22 
 
 
249 aa  85.9  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  30.21 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30.16 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  29.22 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  26.33 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  27.64 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  28.34 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  27.64 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  28.93 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1018  OmpA/MotB domain protein  27.73 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  28.45 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  25.87 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  28.81 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  26.15 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  30.47 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  26.26 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.46 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  26.32 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  28.45 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  29.66 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  26.46 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  26.97 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  26.67 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  24.91 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  26.38 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  28.4 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  25.59 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  28.4 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  27.82 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  29.96 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.45 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  26.46 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3243  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.612152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  26.12 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  27.2 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  25.38 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  32.89 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  24.81 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.42 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  25 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  27.94 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  27.13 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  30.61 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  28.79 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  26.84 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  26.43 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  24.5 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  24.83 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  27.86 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1270  OmpA/MotB  27.78 
 
 
249 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.752029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
242 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  25.68 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  25.1 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  28.09 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  35.38 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  24.2 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  30.96 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0254  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  28.35 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  33.08 
 
 
429 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  31.71 
 
 
179 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2736  OmpA/MotB domain protein  31.23 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  25.95 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  27.48 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  27.48 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  26.19 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2834  OmpA/MotB  28.46 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155442  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.83 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>