More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2912 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2912  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.060006  normal  0.12537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2210  OmpA/MotB domain protein  51.34 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3588  OmpA family protein  41.61 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2737  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.37 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.32 
 
 		 271 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.78 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  26.74 
 
 		 279 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  28.85 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  28.46 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  27.73 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  27.95 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  27.73 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  27.73 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  28.32 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  25.81 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  24.7 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  26.49 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  26.61 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.85 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  28.3 
 
 		 258 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  29.83 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  24.64 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25.94 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  27.54 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  27.89 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  27.24 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  28.57 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  27.34 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  26.03 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  25.46 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.78 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  26.01 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  25.77 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  30.04 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2736  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  25.57 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  23.42 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  27.38 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  28.63 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  26.89 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.17 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  24.82 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  28.05 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  26.64 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  26.41 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  28.2 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.52 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  26.07 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  26.61 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.81 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 248 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  28.26 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  27.56 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  26.52 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  26.16 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  26.64 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  29.11 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3243  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.612152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  27.12 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  25.37 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  30.73 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  30.73 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  23.86 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  30.73 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  29.07 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  27.31 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  27.47 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  34.96 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  29.91 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  25.46 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1018  OmpA/MotB domain protein  25.51 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.2 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  31.39 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  26.09 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  25.46 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  27.35 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  29.36 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  24.11 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  29.46 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  31.39 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  27.73 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2180  OmpA/MotB domain protein  23.08 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.736201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>