More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2180 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2180  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
235 aa  483  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.736201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  67.65 
 
 
241 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  68.51 
 
 
243 aa  333  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1716  chemotaxis protein PomB  34.91 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.81071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  27.87 
 
 
267 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 
223 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  30.6 
 
 
223 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 
223 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  30.74 
 
 
377 aa  95.5  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  28.38 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  29.24 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  30.24 
 
 
376 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  26.27 
 
 
288 aa  92  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  28.52 
 
 
298 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  28.35 
 
 
330 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  27.31 
 
 
257 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.27 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  30.63 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  36.97 
 
 
283 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  31.84 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  27.35 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
290 aa  86.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27.97 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  31.02 
 
 
311 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  26.29 
 
 
273 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  30.36 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  27.84 
 
 
295 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  29.49 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  28.52 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  38.98 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  29.44 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  26.72 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  30.65 
 
 
330 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  26.46 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  27.15 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  27.9 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  36.97 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  28.92 
 
 
421 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  28.92 
 
 
433 aa  82  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  26.67 
 
 
256 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  28.92 
 
 
451 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  27.78 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  25.93 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2358  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.96 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  24.56 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  27.13 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  30.4 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  25.2 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  24.9 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  26.87 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  24.03 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  23.61 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  29.33 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  23.18 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 
340 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 
342 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 
340 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  24.4 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 
340 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  28.17 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  27.78 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  27.78 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  31.52 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  28.96 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  27.27 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  28.32 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  28.23 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  26.92 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  25.3 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  30.47 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  30.74 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.67 
 
 
263 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  27.27 
 
 
339 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  24.89 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  27.27 
 
 
339 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  27.27 
 
 
339 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>