50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0844 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  32.77 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  28.68 
 
 
363 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  32.93 
 
 
393 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  33.64 
 
 
329 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1213  hypothetical protein  32.8 
 
 
413 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000656739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 
360 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10094  hypothetical protein  28 
 
 
282 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 
223 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0273  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287292  normal  0.724459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  38.1 
 
 
384 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  22.58 
 
 
203 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  37.74 
 
 
247 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2588  hypothetical protein  21.99 
 
 
256 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.96 
 
 
376 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2226  putative transmembrane anti-sigma factor  30.63 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0399572  normal  0.233287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  34.94 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  43.5  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2786  hypothetical protein  42.11 
 
 
256 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0857143  decreased coverage  0.000150974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2500  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  26.73 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  27.27 
 
 
331 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2739  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77889e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2544  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000080161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2731  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000018372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  26.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.3 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2147  hypothetical protein  30.38 
 
 
282 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  27.85 
 
 
262 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  36.54 
 
 
347 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 
305 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  38.3 
 
 
356 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  34.62 
 
 
266 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.66 
 
 
271 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  26.04 
 
 
200 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  34.55 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0858  hypothetical protein  37.33 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.60587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1602  hypothetical protein  40.74 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295695  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 
299 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 
297 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 
299 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  43.24 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  43.24 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.03 
 
 
300 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  30.59 
 
 
192 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  32.26 
 
 
327 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  22.54 
 
 
188 aa  40  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  35.71 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  30.56 
 
 
103 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>