43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2225 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  41.1 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  44.9 
 
 
79 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  41.67 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0795  hypothetical protein  31.94 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.753726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11370  hypothetical protein  40.82 
 
 
371 aa  50.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  38.46 
 
 
384 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  40.28 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  44.07 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0333  putative transmembrane anti-sigma factor  44.44 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444258  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  42.37 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  31.51 
 
 
329 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3621  putative transmembrane anti-sigma factor  43.1 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0680768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 
371 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
292 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  33.33 
 
 
285 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  34.25 
 
 
258 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1835  hypothetical protein  34.25 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  47.62 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2633  putative transmembrane anti-sigma factor  48.84 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  47.62 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0090  hypothetical protein  36.21 
 
 
220 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  32.35 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.24 
 
 
271 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  31.03 
 
 
203 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  35.94 
 
 
78 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  33.33 
 
 
221 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1213  hypothetical protein  25.68 
 
 
413 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000656739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  36.67 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.59 
 
 
255 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 
347 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  27.69 
 
 
390 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  35.29 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1547  hypothetical protein  41.3 
 
 
49 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.539405  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  38.78 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  30.88 
 
 
318 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21560  hypothetical protein  31.51 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.22 
 
 
253 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>