21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2572 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  207  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  76.4 
 
 
94 aa  135  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  45.24 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  41.67 
 
 
336 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  35.71 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  35.21 
 
 
360 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.82 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.82 
 
 
288 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  33.82 
 
 
285 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0839  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.36 
 
 
283 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  42.22 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  35.29 
 
 
86 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.56 
 
 
329 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  33.78 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.33 
 
 
376 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  34.67 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 
393 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  34.12 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  34.85 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.62 
 
 
267 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  30.56 
 
 
146 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>