29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3013 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  59.47 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  38.22 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  39.24 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  50.77 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  50.77 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  37.41 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  47.06 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1211  hypothetical protein  49.25 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  45.71 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  47.83 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  32.54 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  42.37 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  42.37 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  45.59 
 
 		 303 aa  47.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2157  hypothetical protein  40.68 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00626531  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1679  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.46544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4007  hypothetical protein  40.68 
 
 		 132 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  44.07 
 
 		 132 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  38.27 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2177  hypothetical protein  38.16 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0913257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  34.25 
 
 		 384 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2125  putative transmembrane anti-sigma factor  45.1 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.266191  normal  0.0344779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2147  hypothetical protein  32.91 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0812  hypothetical protein  34.48 
 
 		 312 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  39.06 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  32.76 
 
 		 412 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11246  hypothetical protein  38.18 
 
 		 193 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246529  hitchhiker  0.00892183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3637  putative transmembrane anti-sigma factor  44.44 
 
 		 84 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>