15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2588 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2588  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2786  hypothetical protein  83.98 
 
 		 256 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0857143  decreased coverage  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2480  putative integral membrane protein  35.69 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000114797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2774  putative integral membrane protein  34.15 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10094  hypothetical protein  32.24 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1274  integral membrane protein  36.41 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5781  hypothetical protein  30.14 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.834779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3771  putative transmembrane anti-sigma factor  48.98 
 
 		 99 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  21.99 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  29.79 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  44.68 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.7 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  41.3 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  41.3 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  43.9 
 
 		 384 aa  42  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>