More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0562 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0562  ABC transporter related  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000187622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  33 
 
 
239 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0792  ABC transporter related  35.53 
 
 
325 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  32.35 
 
 
244 aa  121  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  34.16 
 
 
333 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
435 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  36.1 
 
 
359 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0855  ABC-type transport system, ATPase component  33.5 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.139352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
333 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 
435 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  36.17 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 
378 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 
353 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
356 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  34.63 
 
 
303 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
437 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 
329 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  31.58 
 
 
382 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  33.17 
 
 
326 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  33.17 
 
 
326 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  35.11 
 
 
434 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  31.13 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 
355 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  34.63 
 
 
348 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  34.63 
 
 
348 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  37.02 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
352 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  31.88 
 
 
244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  35.27 
 
 
257 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  33.17 
 
 
329 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  36.36 
 
 
254 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 
365 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.63 
 
 
330 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.85 
 
 
376 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  30.35 
 
 
357 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  35.92 
 
 
356 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  34.15 
 
 
349 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0720  ABC transporter related  37.7 
 
 
230 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
353 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  33.96 
 
 
432 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
336 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  35.12 
 
 
270 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.15 
 
 
346 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
446 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  33.02 
 
 
260 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  35.26 
 
 
218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  32.67 
 
 
333 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  34.13 
 
 
362 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 
371 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
333 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
351 aa  114  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 
330 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  33.33 
 
 
247 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  33.17 
 
 
333 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
333 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 
352 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 
353 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 
357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 
362 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
329 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
366 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  34.13 
 
 
432 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  34.13 
 
 
432 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 
357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  31.86 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  33.01 
 
 
345 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  32.35 
 
 
349 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  33.66 
 
 
365 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.95 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.2 
 
 
332 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  31.22 
 
 
371 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  31.92 
 
 
458 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.76 
 
 
669 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  33.66 
 
 
345 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  33.49 
 
 
249 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  33.98 
 
 
344 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  34.3 
 
 
273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
338 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.22 
 
 
371 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
348 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>