More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4120 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009958  Dshi_4120  sugar transferase  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0243929  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2851  sugar transferase  61 
 
 
219 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1189  sugar transferase  60.5 
 
 
214 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2628  sugar transferase  61.5 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0533  sugar transferase  56.5 
 
 
249 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0912  sugar transferase family protein  34.31 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000418072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  40.91 
 
 
365 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  40.1 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4219  sugar transferase  40 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  40.62 
 
 
200 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  33.17 
 
 
198 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.53 
 
 
459 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  37.36 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34 
 
 
426 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.83 
 
 
217 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.82 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  31.47 
 
 
432 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  37 
 
 
483 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0597  sugar transferase  38.78 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285511  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0608  putative sugar transferase  46.71 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381117  normal  0.777991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1293  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.02 
 
 
485 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  37.93 
 
 
453 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  37 
 
 
200 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.59 
 
 
448 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  35 
 
 
448 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.2 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.76 
 
 
477 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
402 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.61 
 
 
449 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2640  sugar transferase  37.62 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.961437  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  37.07 
 
 
329 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  34.67 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  36.32 
 
 
454 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  34.87 
 
 
467 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  34.33 
 
 
464 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2642  sugar transferase  35.03 
 
 
229 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759393  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1573  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  33.18 
 
 
470 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0995  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.41 
 
 
477 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.69 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  39.89 
 
 
465 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0013  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.05 
 
 
466 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1281  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  28.57 
 
 
426 aa  108  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  39.11 
 
 
548 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2815  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.31 
 
 
225 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  35.5 
 
 
200 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  39.9 
 
 
436 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.29 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  34.15 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1305  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  32.16 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  35.64 
 
 
437 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  31.73 
 
 
219 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  35 
 
 
200 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  31.92 
 
 
252 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0929  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  27.94 
 
 
426 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.509222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  35 
 
 
202 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  35.53 
 
 
468 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  32.86 
 
 
201 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.12 
 
 
456 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.67 
 
 
470 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  34 
 
 
459 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.55 
 
 
475 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  46.46 
 
 
468 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.99 
 
 
476 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.18 
 
 
450 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.95 
 
 
196 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  31.12 
 
 
466 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.33 
 
 
207 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.03 
 
 
465 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.83 
 
 
460 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.32 
 
 
427 aa  104  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  29.25 
 
 
220 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  32.69 
 
 
351 aa  104  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.71 
 
 
461 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3807  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.56 
 
 
493 aa  104  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.25829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.5 
 
 
204 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.86 
 
 
448 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.32 
 
 
201 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  34 
 
 
459 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2093  sugar transferase  31.73 
 
 
235 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0636821  hitchhiker  0.00000177418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2782  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.08 
 
 
244 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.96 
 
 
451 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  39.11 
 
 
494 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3319  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.08 
 
 
244 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.260704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2344  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.5 
 
 
232 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.33 
 
 
465 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  37.99 
 
 
494 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20081  galactosyl-1-phosphate transferase  36.32 
 
 
252 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5291  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.08 
 
 
239 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1846  glycosyl transferase domain-containing protein  32.69 
 
 
277 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1061  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.64 
 
 
489 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.176215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.53 
 
 
471 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.99 
 
 
522 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3367  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.19 
 
 
480 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0300  sugar transferase  41.48 
 
 
201 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.98 
 
 
491 aa  101  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  34.33 
 
 
329 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.83 
 
 
346 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2744  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.19 
 
 
480 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000314973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.65 
 
 
477 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.18 
 
 
477 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.438937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>