More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2642 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2642  sugar transferase  100 
 
 
229 aa  463  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759393  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3116  sugar transferase  66.22 
 
 
222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2640  sugar transferase  49.28 
 
 
229 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.961437  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  39.27 
 
 
202 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  40.31 
 
 
198 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  37.5 
 
 
365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0597  sugar transferase  37.95 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285511  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  38.33 
 
 
200 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  33.92 
 
 
199 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0912  sugar transferase family protein  34.44 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000418072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0300  sugar transferase  38.6 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0608  putative sugar transferase  40.37 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381117  normal  0.777991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4219  sugar transferase  33.9 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3807  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  31.79 
 
 
493 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.25829 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0883  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.58 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  36.6 
 
 
216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1939  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.3 
 
 
496 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17381  galactosyl-1-phosphate transferase  34.58 
 
 
250 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.5 
 
 
459 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1305  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  34.03 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.5 
 
 
456 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  36.92 
 
 
186 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  36.27 
 
 
188 aa  111  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.94 
 
 
460 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  35.94 
 
 
460 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.33 
 
 
477 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.36 
 
 
470 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.94 
 
 
460 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.98 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  35.75 
 
 
186 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  34.36 
 
 
329 aa  109  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.99 
 
 
471 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.38 
 
 
448 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2744  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.26 
 
 
480 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000314973 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4120  sugar transferase  35.03 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0243929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3367  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.26 
 
 
480 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  33.33 
 
 
215 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  38.41 
 
 
512 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  33.56 
 
 
185 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  33.56 
 
 
185 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  35.42 
 
 
460 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  32.49 
 
 
466 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.73 
 
 
506 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  32.64 
 
 
457 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  38 
 
 
466 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.71 
 
 
506 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1703  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.71 
 
 
511 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0935267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.71 
 
 
496 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.33 
 
 
454 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.71 
 
 
477 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.75 
 
 
512 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.82 
 
 
465 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3206  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.08 
 
 
481 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.73 
 
 
461 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  36.02 
 
 
209 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.2 
 
 
521 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.2 
 
 
520 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.54 
 
 
196 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.36 
 
 
468 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  34.34 
 
 
186 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.76 
 
 
468 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.25 
 
 
456 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  39.19 
 
 
225 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  31.77 
 
 
471 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0481  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.48 
 
 
466 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.17 
 
 
231 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0975  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.63 
 
 
391 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0624997  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3559  sugar transferase  35.5 
 
 
249 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4240  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  31.5 
 
 
462 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.322469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0786  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.24 
 
 
506 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.21233  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  31.58 
 
 
219 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.15 
 
 
522 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1663  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.93 
 
 
516 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  32.46 
 
 
186 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  32.46 
 
 
187 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.41 
 
 
461 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.8 
 
 
461 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  33.5 
 
 
471 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.62 
 
 
505 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.77 
 
 
474 aa  101  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  31.77 
 
 
445 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2648  sugar transferase  39.58 
 
 
202 aa  101  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1810  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.82 
 
 
510 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.179884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  33.85 
 
 
186 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.33 
 
 
473 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0295  sugar transferase  37.84 
 
 
214 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0837  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.43 
 
 
252 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.893077  hitchhiker  0.000731888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  37.16 
 
 
212 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.71 
 
 
502 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00967107  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4832  sugar transferase  33.53 
 
 
473 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0290406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5936  structural protein  33.33 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.07 
 
 
470 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  29.21 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2005  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  35.59 
 
 
649 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20081  galactosyl-1-phosphate transferase  31.92 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.83 
 
 
454 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4441  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.47 
 
 
594 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.796924  normal  0.559619 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0454  glycosyltransferase, putative  31.73 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000102874  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  32.65 
 
 
464 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  39.58 
 
 
490 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>