More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0300 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0300  sugar transferase  100 
 
 
201 aa  396  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0597  sugar transferase  62.83 
 
 
198 aa  227  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285511  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  51.28 
 
 
202 aa  211  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0608  putative sugar transferase  62.19 
 
 
201 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381117  normal  0.777991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  50.51 
 
 
198 aa  201  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  46.88 
 
 
365 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  50.26 
 
 
200 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  47.94 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0912  sugar transferase family protein  41.58 
 
 
200 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000418072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4219  sugar transferase  45.6 
 
 
195 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  45.4 
 
 
199 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  44.39 
 
 
548 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2642  sugar transferase  39.29 
 
 
229 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759393  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1835  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.34 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.68976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  39.6 
 
 
458 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1018  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.86 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.408286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  32.37 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1703  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.31 
 
 
511 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0935267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2640  sugar transferase  42.36 
 
 
229 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.961437  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.23 
 
 
448 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  55.24 
 
 
482 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3681  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.35 
 
 
571 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  40.3 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  44.12 
 
 
459 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.69 
 
 
231 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3116  sugar transferase  41.03 
 
 
222 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.7 
 
 
501 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  40.39 
 
 
447 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.42 
 
 
502 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00967107  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2070  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.81 
 
 
247 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0466  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.42 
 
 
222 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000106234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  41.41 
 
 
216 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.71 
 
 
491 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  40.3 
 
 
436 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0630  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.71 
 
 
484 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  38.58 
 
 
483 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.86 
 
 
477 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0052  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.76 
 
 
532 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6387  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.29 
 
 
522 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.54 
 
 
469 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.64 
 
 
443 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.5 
 
 
450 aa  121  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1830  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.28 
 
 
239 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.911753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  43.24 
 
 
484 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1846  glycosyl transferase domain-containing protein  35.44 
 
 
277 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.2 
 
 
457 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1363  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.14 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.585717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.35 
 
 
461 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1293  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.44 
 
 
485 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.48 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.35 
 
 
477 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.32 
 
 
346 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  47.52 
 
 
242 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.49 
 
 
454 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0454  glycosyltransferase, putative  33.49 
 
 
222 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000102874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2455  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.91 
 
 
470 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0526782  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4120  sugar transferase  41.09 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0243929  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1500  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.22 
 
 
470 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0289013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  39.6 
 
 
472 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  43.53 
 
 
187 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.78 
 
 
336 aa  118  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5296  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.15 
 
 
488 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.32 
 
 
473 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  34.83 
 
 
329 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1810  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.86 
 
 
510 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.179884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1305  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  36.04 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3721  sugar transferase  45.39 
 
 
362 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.243024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1932  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.13 
 
 
518 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.32 
 
 
472 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.44 
 
 
488 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  42.55 
 
 
469 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5557  galactosyl transferase CpsE  40.54 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000713124  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  35.71 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  35.29 
 
 
464 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  37.13 
 
 
437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  40.54 
 
 
228 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4832  sugar transferase  36.49 
 
 
473 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0290406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  44.85 
 
 
459 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3559  sugar transferase  42.02 
 
 
249 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  34.33 
 
 
358 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  35.71 
 
 
230 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  37.68 
 
 
464 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.31 
 
 
490 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2648  sugar transferase  44.85 
 
 
202 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.18 
 
 
498 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  36.14 
 
 
473 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3589  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.49 
 
 
504 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.14 
 
 
473 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  37.06 
 
 
464 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  49.3 
 
 
465 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.31 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2949  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.12 
 
 
478 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3584  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.49 
 
 
504 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356209  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3657  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.49 
 
 
504 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.31 
 
 
465 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1374  sugar transferase  35.55 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>