More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3559 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3559  sugar transferase  100 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  39.38 
 
 
215 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  39.49 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  39.04 
 
 
365 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.7 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  35.86 
 
 
216 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  36.41 
 
 
198 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0912  sugar transferase family protein  32.45 
 
 
200 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000418072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  39.75 
 
 
432 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2642  sugar transferase  35.68 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759393  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0300  sugar transferase  39.63 
 
 
201 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3108  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.71 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  35.05 
 
 
202 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0597  sugar transferase  39.18 
 
 
198 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285511  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0608  putative sugar transferase  42.95 
 
 
201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381117  normal  0.777991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4219  sugar transferase  35.16 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.7 
 
 
475 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  32.38 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3807  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.92 
 
 
493 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.25829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2370  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.87 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.335038  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.21 
 
 
502 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00967107  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  36.41 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0575  sugar transferase  31.31 
 
 
416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00082659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.65 
 
 
470 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  32.18 
 
 
448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  32.95 
 
 
199 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.61 
 
 
206 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  38.71 
 
 
461 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.02 
 
 
459 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0035  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.03 
 
 
487 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  39.58 
 
 
548 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  36.81 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.62 
 
 
217 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8502  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.97 
 
 
510 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  31.78 
 
 
408 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1500  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39 
 
 
470 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0289013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.44 
 
 
457 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.02 
 
 
471 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  35.33 
 
 
459 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.08 
 
 
465 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2455  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38 
 
 
470 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0526782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.35 
 
 
498 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.07 
 
 
448 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.35 
 
 
201 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1281  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  28.23 
 
 
426 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.12 
 
 
463 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  41.22 
 
 
465 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  34.83 
 
 
242 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  44.37 
 
 
452 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3218  sugar transferase  44.83 
 
 
467 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.9 
 
 
473 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1370  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase, putative  34.91 
 
 
484 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.419276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.02 
 
 
219 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  35.75 
 
 
454 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.18 
 
 
219 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  33.84 
 
 
458 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  34.39 
 
 
466 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.22 
 
 
454 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0995  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.32 
 
 
477 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0929  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  27.04 
 
 
426 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.509222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.78 
 
 
512 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.67 
 
 
461 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  30.95 
 
 
207 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.62 
 
 
408 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  40.1 
 
 
443 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  30.29 
 
 
219 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2648  sugar transferase  35.76 
 
 
202 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1135  sugar transferase  43.24 
 
 
204 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.734647 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1184  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.36 
 
 
507 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0885  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.84 
 
 
509 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.532275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  31.98 
 
 
469 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  31.94 
 
 
464 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.04 
 
 
463 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  43.84 
 
 
460 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.01 
 
 
498 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.67 
 
 
461 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4120  sugar transferase  35.18 
 
 
202 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0243929  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1181  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.43 
 
 
245 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  31.98 
 
 
230 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  31.47 
 
 
194 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.88 
 
 
477 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  37.17 
 
 
436 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  35.08 
 
 
464 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2689  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.52 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0013  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.11 
 
 
466 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0143  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.01 
 
 
499 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.381728  normal  0.0528776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2628  sugar transferase  36.47 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1703  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.38 
 
 
511 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0935267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3116  sugar transferase  34.17 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4532  sugar transferase  35.68 
 
 
505 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.97 
 
 
469 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.11 
 
 
450 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.51 
 
 
476 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0466  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.16 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000106234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  29.82 
 
 
464 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.15 
 
 
461 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1064  sugar transferase  32.39 
 
 
378 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  40.56 
 
 
459 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  37.71 
 
 
441 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>