More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1189 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1189  sugar transferase  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2851  sugar transferase  99.07 
 
 
219 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2628  sugar transferase  78.77 
 
 
214 aa  313  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4120  sugar transferase  60.5 
 
 
202 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0243929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0533  sugar transferase  49.07 
 
 
249 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  41.63 
 
 
365 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  38.66 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0912  sugar transferase family protein  32.67 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000418072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  36.73 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.05 
 
 
462 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  38.24 
 
 
483 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.56 
 
 
476 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4219  sugar transferase  37.37 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  31.07 
 
 
432 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  36.59 
 
 
460 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  35.24 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.07 
 
 
470 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.86 
 
 
459 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.01 
 
 
426 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  38.61 
 
 
461 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.45 
 
 
501 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1135  sugar transferase  33.5 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.734647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  33.82 
 
 
464 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0608  putative sugar transferase  45.68 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381117  normal  0.777991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0929  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.52 
 
 
426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.509222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  36.63 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.22 
 
 
219 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  37 
 
 
202 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  31.67 
 
 
252 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.5 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  32.49 
 
 
466 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.65 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.41 
 
 
463 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  32.49 
 
 
198 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2640  sugar transferase  42.14 
 
 
229 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.961437  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1281  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.07 
 
 
426 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  31.86 
 
 
214 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.81 
 
 
219 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  34.76 
 
 
351 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  38.8 
 
 
465 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.58 
 
 
460 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.95 
 
 
217 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.1 
 
 
475 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.8 
 
 
477 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0575  sugar transferase  31.9 
 
 
416 aa  104  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00082659  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  40.24 
 
 
468 aa  104  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  38.01 
 
 
467 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  34.15 
 
 
459 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.78 
 
 
450 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  35.71 
 
 
197 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.1 
 
 
484 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.3 
 
 
465 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  37.68 
 
 
463 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.03 
 
 
199 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1293  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.06 
 
 
485 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  34.36 
 
 
464 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4384  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.01 
 
 
234 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.99 
 
 
212 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.2 
 
 
469 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4446  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.01 
 
 
234 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  36.56 
 
 
470 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.21 
 
 
408 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.68 
 
 
451 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  31.73 
 
 
408 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.82 
 
 
231 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  32.86 
 
 
242 aa  101  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.57 
 
 
465 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  30.43 
 
 
473 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2615  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.47 
 
 
499 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1305  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.95 
 
 
243 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5291  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.01 
 
 
239 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0597  sugar transferase  38.92 
 
 
198 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285511  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1269  sugar transferase  34.1 
 
 
197 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.923521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  34.18 
 
 
204 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
467 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.5 
 
 
212 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.5 
 
 
212 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.5 
 
 
212 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3807  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.82 
 
 
493 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.25829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.88 
 
 
456 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2190  sugar transferase  33.18 
 
 
475 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000191042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  35.92 
 
 
452 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.13 
 
 
454 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  35.96 
 
 
447 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.5 
 
 
475 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  37.64 
 
 
459 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1504  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  32.69 
 
 
237 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.5 
 
 
498 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2093  sugar transferase  33.49 
 
 
235 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0636821  hitchhiker  0.00000177418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  36.52 
 
 
459 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.47 
 
 
522 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1171  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.44 
 
 
501 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.23 
 
 
302 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1044  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.44 
 
 
501 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.0474242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.23 
 
 
463 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  35.15 
 
 
475 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.06 
 
 
491 aa  98.2  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.48 
 
 
469 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  37.95 
 
 
216 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.5 
 
 
470 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>