More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0533 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0533  sugar transferase  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4120  sugar transferase  56.5 
 
 		 202 aa  221  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0243929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2628  sugar transferase  53.5 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2851  sugar transferase  49.76 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1189  sugar transferase  49.28 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  37.91 
 
 		 365 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.2 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  39.38 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  40.5 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  39.7 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0597  sugar transferase  42.5 
 
 		 198 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  36 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  34.65 
 
 		 432 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.65 
 
 		 463 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  39.2 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.71 
 
 		 465 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  35.15 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  34.91 
 
 		 483 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0912  sugar transferase family protein  32.02 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000418072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2589  sugar transferase  33.33 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.89 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36 
 
 		 459 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  37.81 
 
 		 461 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3319  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.72 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.260704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2782  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.72 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0489  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  32.35 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90918  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.27 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4219  sugar transferase  36.41 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.6 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  36.32 
 
 		 460 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.6 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.98 
 
 		 461 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.8 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.68 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.6 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.31 
 
 		 460 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.81 
 
 		 445 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.14 
 
 		 473 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  35.68 
 
 		 197 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.32 
 
 		 471 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  33.33 
 
 		 201 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2689  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.19 
 
 		 252 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  34.17 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.19 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.81 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.2 
 
 		 448 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  39.6 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2023  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.45 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  hitchhiker  0.0000000000460797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  36.89 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  36.8 
 
 		 453 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2093  sugar transferase  30.86 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0636821  hitchhiker  0.00000177418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.3 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  35.82 
 
 		 448 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  31.97 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 467 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.83 
 
 		 484 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2815  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.29 
 
 		 225 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  38.61 
 
 		 464 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.98 
 
 		 460 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  35.98 
 
 		 460 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  35.98 
 
 		 460 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0586  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.68 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  35.98 
 
 		 460 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.98 
 
 		 461 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0653  sugar transferase  35.05 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  34.16 
 
 		 466 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.98 
 
 		 460 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.98 
 
 		 460 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1975  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.87 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498366  normal  0.201903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  35.78 
 
 		 464 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.23 
 
 		 469 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3274  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.35 
 
 		 203 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.98 
 
 		 468 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1206  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.77 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  35.55 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5254  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.59 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  35.64 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  30.84 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3034  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.68 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3394  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.28 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.27 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5936  structural protein  32.24 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  38.27 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17381  galactosyl-1-phosphate transferase  31.82 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.27 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  37.24 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2190  sugar transferase  33.95 
 
 		 475 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000191042  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0883  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  31.82 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.5 
 
 		 458 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0608  putative sugar transferase  38.35 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381117  normal  0.777991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2547  exopolysaccharide production protein exoY  35.21 
 
 		 203 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  37.58 
 
 		 450 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.15 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0929  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.34 
 
 		 426 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.509222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.64 
 
 		 427 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  37.44 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.94 
 
 		 477 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  36.73 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0831  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  32.26 
 
 		 474 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1305  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  32.18 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>