38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0574 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  344  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  39.71 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  36.44 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  34.45 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  33.61 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  32.76 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  27.07 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  30.15 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  29.11 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  27.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  28.99 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  27.5 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  27.72 
 
 		 439 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  30.3 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  27.4 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  35.48 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  29.7 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  37.88 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  26.57 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  29.36 
 
 		 207 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  26.96 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2168  hypothetical protein  26.83 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  25.86 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  30.48 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  29.92 
 
 		 229 aa  44.3  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  24.03 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  28.87 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  31.07 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  29.32 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  37.29 
 
 		 192 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  22.7 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  27.48 
 
 		 265 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  28.16 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>