25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0058 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  332  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  29.11 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  26.36 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  28.26 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  32.73 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  29.25 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0417  hypothetical protein  25.6 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  27.27 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  24.78 
 
 		 258 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  23.57 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  27.42 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  29.59 
 
 		 439 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  29.91 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  29.41 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  22.06 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  27.81 
 
 		 192 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  28.97 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  24.78 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  23.89 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  34.55 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  38.6 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  24.78 
 
 		 255 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>