33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1187 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  329  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  39.71 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  37.17 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  37.25 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  31.53 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  31.36 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  34.55 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  39.78 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  30.4 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  32.43 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  28.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.69 
 
 		 254 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  33.64 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  26.76 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  26.77 
 
 		 255 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  27.52 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  27.33 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  30.36 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  30.84 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  26.13 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  25.71 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  33.65 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  26.81 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  35.35 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  27.78 
 
 		 439 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  23.62 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  33.7 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  23.57 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  23.58 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  28.05 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  25.45 
 
 		 241 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  34.48 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>