27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1394 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  63.39 
 
 
214 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  56.64 
 
 
219 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  49.12 
 
 
439 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  34.45 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  34.33 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  32.14 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  31.29 
 
 
238 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  28.03 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  31.53 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  27.67 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  29.38 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  28.64 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  28.8 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  30.1 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  32.29 
 
 
253 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  26.5 
 
 
192 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  30.09 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  29.57 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  24.83 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  27.74 
 
 
164 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  26.99 
 
 
229 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  26.43 
 
 
182 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  30.28 
 
 
180 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  27.21 
 
 
164 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3431  hypothetical protein  23.3 
 
 
179 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>