25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3917 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  322  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  96.32 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  56.52 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  49.66 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  53.97 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3431  hypothetical protein  42.96 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3299  hypothetical protein  42.96 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  31.91 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  29.73 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  26.87 
 
 		 259 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  24.76 
 
 		 256 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  28.07 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  28.72 
 
 		 266 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  23.57 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  28.7 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  27.84 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  22.34 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  26.97 
 
 		 439 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  31.73 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  26.21 
 
 		 229 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  22.4 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  21.62 
 
 		 295 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>