31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4418 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  79.53 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  78.38 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  67.32 
 
 		 255 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  63.06 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  62.69 
 
 		 267 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  65.23 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  41.47 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  41.09 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  40.7 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  45.88 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  44.51 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  42.33 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  46.92 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  38.52 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  26.78 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  31.01 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  23.89 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  26.89 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  26.36 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  22.93 
 
 		 182 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  27.69 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  28.67 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  27.91 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  23.86 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  29.13 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  29.13 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>