29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2950 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  40.89 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  54.96 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  52.67 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  51.91 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  36.51 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  29.87 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  28.69 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  32.28 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  29.46 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  27.1 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  27.07 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  30.08 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.01 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  28.49 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  29.77 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  29.37 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  28.46 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  33.75 
 
 		 439 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  29.12 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  29.01 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  30.36 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  27.48 
 
 		 265 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  27.48 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>