38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2838 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  33.78 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  37.04 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  38.52 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  40.94 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.17 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  34.81 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  38.58 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  36.92 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  35.34 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  32.27 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  36.15 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  35.37 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  35.38 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  32.05 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  29.24 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  33.05 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  27.59 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  32.46 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  24.75 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  28.28 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  33.85 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  31.06 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  28.16 
 
 		 169 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  27.93 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  27.19 
 
 		 439 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  38.33 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  29.51 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  22.76 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  25.44 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  27.87 
 
 		 185 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  27.87 
 
 		 185 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0417  hypothetical protein  31.15 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  25.17 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  29.89 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>