33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1126 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  79.85 
 
 
266 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  62.73 
 
 
255 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  61.42 
 
 
254 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  60.66 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  60.82 
 
 
255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  61.85 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  39.51 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  46.24 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  37.86 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  45.5 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  37.86 
 
 
265 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  48.44 
 
 
253 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  46.38 
 
 
286 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  40.31 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  36.76 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  29.56 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  29.23 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  30.08 
 
 
205 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  28.21 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  30.48 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  26.96 
 
 
208 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  28.07 
 
 
214 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  27.56 
 
 
180 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  22.12 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  28.15 
 
 
229 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  32.14 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  24.17 
 
 
439 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0943  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  22.34 
 
 
164 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  22.34 
 
 
164 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>