33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3261 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  42.7 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  42.7 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  43.43 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  39.73 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  36.04 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  30.3 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  32.58 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  31.01 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  31.75 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  33.88 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  30.08 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  30.88 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  31.97 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  30.83 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  32.2 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  31.03 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  31.75 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.61 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  31.97 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  29.03 
 
 		 286 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  31.75 
 
 		 265 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  29.75 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  27.62 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  27.59 
 
 		 325 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  33.88 
 
 		 424 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  29.09 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  28.45 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  29.79 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  26.83 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>