22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3107 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  353  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  73.64 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  49.66 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  53.28 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3431  hypothetical protein  39.31 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3299  hypothetical protein  34.74 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  30.22 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  26.21 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  24.78 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  23.65 
 
 		 255 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  23.19 
 
 		 254 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  23.01 
 
 		 256 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  29.57 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  23.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  28.26 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  25.86 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  26.73 
 
 		 325 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  33.65 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  33.73 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>