29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0697 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  42.11 
 
 
214 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  49.12 
 
 
325 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  38.46 
 
 
219 aa  90.1  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  24.5 
 
 
266 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  27.72 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  29.73 
 
 
265 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  26.05 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  29.57 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  33.75 
 
 
205 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  29 
 
 
176 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  23.2 
 
 
255 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  28.83 
 
 
265 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  30.84 
 
 
180 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  27.52 
 
 
256 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  29.9 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  24.14 
 
 
255 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  24.17 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  29.52 
 
 
179 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0837  hypothetical protein  23.48 
 
 
145 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0176357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  29.59 
 
 
170 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  28.41 
 
 
254 aa  43.9  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  24.7 
 
 
259 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  23 
 
 
177 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>