24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0261 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  59.64 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  63.5 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  59.64 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  55.22 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  47.2 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  46.58 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  54.62 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  46.56 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  45.26 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  43.85 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  46.62 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  47.97 
 
 		 194 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  39.37 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  50.49 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  46.15 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  50.49 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  29.52 
 
 		 439 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  28.85 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  29.33 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  30.61 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  30.48 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  28.81 
 
 		 214 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>