22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0602 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  100 
 
 
194 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  90.72 
 
 
194 aa  310  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  90.21 
 
 
194 aa  309  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  74.63 
 
 
177 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  63.16 
 
 
207 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  50.96 
 
 
206 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  55.3 
 
 
190 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  54.55 
 
 
180 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  56.56 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  54.31 
 
 
177 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  39.31 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  48.51 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  45.97 
 
 
179 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  47.41 
 
 
189 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  37.59 
 
 
180 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  47.83 
 
 
254 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  38.35 
 
 
179 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  28.83 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2113  hypothetical protein  29.63 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.517967  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  28.43 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  27.81 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>