23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3650 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  53.74 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  58.2 
 
 		 241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  46.76 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  41.1 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  40.41 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  49.04 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  36.3 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  42.28 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  42.28 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  42.28 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  41.94 
 
 		 172 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  38.33 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  36.72 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  36.07 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  29.46 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  32.32 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  29.81 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  31.11 
 
 		 325 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  28.89 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  38.78 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>