24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3679 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  344  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  74.63 
 
 
194 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  78.51 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  77.24 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  67.2 
 
 
207 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  56.67 
 
 
241 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  54.17 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  54.17 
 
 
190 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  51.75 
 
 
177 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  54.17 
 
 
180 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  46.76 
 
 
194 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  50.81 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  46.46 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  45.67 
 
 
189 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  35.71 
 
 
180 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  35.26 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  42.5 
 
 
254 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  29.7 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  24.86 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  23.3 
 
 
439 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  33.7 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  36.21 
 
 
192 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  25.19 
 
 
182 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2113  hypothetical protein  27.78 
 
 
207 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.517967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>