27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0743 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  56.07 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  65.15 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  56.07 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  55.04 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  44.36 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  44.36 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  48.33 
 
 		 206 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  40.15 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  42.75 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  43.88 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  37.25 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  39.87 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  37.4 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  48.08 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  48.08 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  33.66 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  27.72 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  27.36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  31.18 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1360  hypothetical protein  43.1 
 
 		 323 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.020201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  34.02 
 
 		 325 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  26.85 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  30.19 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  30.17 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  30.17 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>