22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1100 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  58.2 
 
 		 194 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  49.02 
 
 		 177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  54.69 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  56.06 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  45.64 
 
 		 190 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  45.64 
 
 		 180 aa  118  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  44.23 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  60.58 
 
 		 194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  59.62 
 
 		 194 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  59.62 
 
 		 194 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  40.51 
 
 		 180 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  41.1 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  45.99 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  39.67 
 
 		 189 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  44.07 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  30.1 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  29.27 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  28.87 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  25.66 
 
 		 439 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>