24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0292 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  340  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  51.75 
 
 
189 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  47.18 
 
 
180 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  49.06 
 
 
179 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  47.65 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  52 
 
 
206 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  52 
 
 
180 aa  131  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  52 
 
 
190 aa  131  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  41.56 
 
 
254 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  47.58 
 
 
241 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  50.82 
 
 
194 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  50.82 
 
 
194 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  51.67 
 
 
194 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  50.81 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  46.55 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  41.94 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  35.48 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  26.6 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  35.05 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  29.63 
 
 
439 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  38.67 
 
 
192 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  28.74 
 
 
180 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>