24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1786 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  72.87 
 
 
187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  46.24 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1925  hypothetical protein  43.68 
 
 
175 aa  148  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  45.61 
 
 
172 aa  128  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  45.61 
 
 
172 aa  128  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  42.94 
 
 
172 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  41.32 
 
 
171 aa  122  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  37.42 
 
 
170 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  27.15 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  35 
 
 
254 aa  49.7  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  27.61 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  30.09 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  27.61 
 
 
206 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  29.46 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  26.6 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  31.52 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  28.12 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  22.22 
 
 
417 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  22.22 
 
 
431 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  22.22 
 
 
431 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  30.3 
 
 
421 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  24.51 
 
 
435 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  25.51 
 
 
207 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>