29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0355 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  100 
 
 
180 aa  361  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  94.44 
 
 
179 aa  317  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  59.64 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  62.04 
 
 
189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  47.18 
 
 
172 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  44.9 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  44.3 
 
 
190 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  45.7 
 
 
180 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  43.45 
 
 
177 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  44.19 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  43.18 
 
 
254 aa  104  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  44.35 
 
 
207 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  36.3 
 
 
194 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  40.34 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  38.46 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  29.63 
 
 
325 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  26.57 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  30.09 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  30.84 
 
 
439 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  27.33 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  31.03 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  31.03 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  33.66 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  30.17 
 
 
172 aa  42  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  30.77 
 
 
253 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  28.97 
 
 
170 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>