22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0624 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  97.94 
 
 		 194 aa  342  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  90.72 
 
 		 194 aa  287  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  77.24 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  66.12 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  50.96 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  54.26 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  53.49 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  55.74 
 
 		 241 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  54.31 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  40.46 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  50.82 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  45.97 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  47.41 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  37.59 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  48.7 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  38.35 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  27.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  27.93 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  35.09 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2113  hypothetical protein  28.7 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.517967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>