27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0030 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  349  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  53.74 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  53.28 
 
 		 241 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  51.09 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4206  hypothetical protein  46.46 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.697286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  43.45 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0157  hypothetical protein  47.54 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0141  hypothetical protein  47.54 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.668994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  45.38 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  43.31 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0624  hypothetical protein  53.85 
 
 		 194 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0635  hypothetical protein  53.85 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  45.77 
 
 		 207 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0602  conserved hypothetical proteinn  53.85 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0292  hypothetical protein  46.15 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  43.36 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1138  hypothetical protein  41.67 
 
 		 254 aa  90.5  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  28.38 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  30.3 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  37.29 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  29.46 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  29.46 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  30.84 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  29.03 
 
 		 439 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  29.17 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  29.29 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>