27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4717 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  69.23 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  60.82 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  56.49 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  56.49 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  56.35 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  41.18 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  42.15 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  41.08 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  40.69 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  40.44 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  40.34 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  41.15 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  45.64 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  34.21 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  37.4 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  27.83 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  28.32 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  29.41 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  26.05 
 
 		 439 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  32.46 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  37.29 
 
 		 185 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  37.29 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  23.02 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  26.05 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>