22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1116 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1116  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2008  hypothetical protein  41.06 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  34.13 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  31.34 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  27.45 
 
 
187 aa  52.4  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  51.6  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  36.25 
 
 
422 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  25.74 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  36.36 
 
 
402 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  27.33 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  33.33 
 
 
430 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  31.9 
 
 
427 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0854  hypothetical protein  25.44 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  26.29 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  36.36 
 
 
427 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  44.44 
 
 
412 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  32.05 
 
 
431 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  24.78 
 
 
255 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  44.9 
 
 
435 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  32.18 
 
 
424 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  33.33 
 
 
435 aa  41.6  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>