58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1108 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1108  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0981  hypothetical protein  36.71 
 
 
280 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00101164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  22.54 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  23.24 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  22.45 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3129  adenosylcobinamide kinase  31.25 
 
 
507 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  38.1 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  36.05 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
252 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 
251 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  34.52 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  34.52 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  35.71 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  22.84 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1789  cobalbumin biosynthesis protein  29.63 
 
 
471 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  23.96 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1298  PhnP-like protein  27.6 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  24.31 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  32.94 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  23.29 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.35 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 
259 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  36.9 
 
 
260 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 
263 aa  45.8  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  39.08 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  32.14 
 
 
100 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.57 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  30.21 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  32.26 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.49 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  31.4 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.33 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.76 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  34.12 
 
 
260 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  34.12 
 
 
260 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>