More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_984 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1201  carbamoyl phosphate synthase small subunit  98.35 
 
 		 364 aa  751    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_984  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  100 
 
 		 364 aa  758    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1011  carbamoyl phosphate synthase small subunit  88.19 
 
 		 364 aa  693    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0372  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.79 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.386907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1683  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.79 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.45 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1250  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.55 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0156  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.27 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.983052  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0009  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.4 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.35972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0881  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  49.73 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0218  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.9 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2353  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.83 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00528586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2349  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.45 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1303  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.42 
 
 		 359 aa  359  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0780078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0107  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.95 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2032  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.28 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3203  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.68 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2282  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.79 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4410  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.53 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0768  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.63 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2299  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.09 
 
 		 369 aa  352  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000401664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1613  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.09 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0266912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2191  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.7 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2643  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.85 
 
 		 374 aa  349  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02880  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50 
 
 		 364 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.422195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0950  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.61 
 
 		 357 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2240  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.18 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1046  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.55 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.38 
 
 		 386 aa  346  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.663891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1620  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.84 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2328  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.18 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2194  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  47.15 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1916  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.42 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1273  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.63 
 
 		 374 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4055  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.84 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1942  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.83 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230816  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1361  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.99 
 
 		 376 aa  342  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2113  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.87 
 
 		 371 aa  342  8e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000982338  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1858  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.92 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0120  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.6 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1307  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.62 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0615  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.5 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1371  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.75 
 
 		 368 aa  338  7e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1771  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.55 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0224697  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.03 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1540  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.03 
 
 		 356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1968  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.01 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.837999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1261  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.15 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2577  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.74 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1286  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.15 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.510283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00036  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3567  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00035  hypothetical protein  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0033  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.33 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1071  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.75 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0749952  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1820  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.77 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3196  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.84 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0368063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2122  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.57 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.618886 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0836  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.32 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0585  carbamoyl phosphate synthase small subunit  43.86 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0152244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3623  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.06 
 
 		 382 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.72 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.162276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  43.8 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3019  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  45.53 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.43 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.43 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28074  Carbamoyl-phosphate synthase S chain  44.59 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.210414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0268  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.74 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1043  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.31 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4432  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.82 
 
 		 380 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2536  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.78 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2483  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.83 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000863462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0896  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  44.83 
 
 		 378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  0.560722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1256  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.78 
 
 		 365 aa  328  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1774  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.18 
 
 		 393 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2083  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.09 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1081  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.49 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.621678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1731  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.27 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1915  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.67 
 
 		 390 aa  328  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004479  carbamoyl-phosphate synthase small chain  44.15 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0379  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.36 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0661  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.71 
 
 		 356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0362  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.36 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0108123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0698  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  44.56 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.110228 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0558  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.46 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3714  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.22 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.971369  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0809  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.28 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1290  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.28 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0948613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1261  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.28 
 
 		 380 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0131767  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4242  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  43.01 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2703  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  46.51 
 
 		 388 aa  325  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.614253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3985  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.94 
 
 		 365 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.289727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3932  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.94 
 
 		 365 aa  325  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3936  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.94 
 
 		 365 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0146429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2913  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.52 
 
 		 351 aa  325  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1608  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.68 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0587  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.68 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>