More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0615 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0615  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  100 
 
 		 360 aa  741    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0950  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  72.07 
 
 		 357 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  56.82 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2577  carbamoyl phosphate synthase small subunit  56.25 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1303  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.09 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0780078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1683  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  54.7 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1046  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.65 
 
 		 364 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1916  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.08 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0881  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.83 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0372  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.83 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.386907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1307  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.56 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2353  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  54.52 
 
 		 358 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00528586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2913  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  53.95 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2670  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  55.08 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3646  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.82 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1613  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.94 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0266912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1540  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  53.09 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2483  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.28 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000863462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2536  carbamoyl phosphate synthase small subunit  52.41 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3932  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.54 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3714  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.26 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.971369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3738  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.82 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3629  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.82 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4026  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.82 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0667428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3985  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.54 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.289727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3936  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.54 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0146429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1256  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.26 
 
 		 365 aa  381  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3901  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.82 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000355158 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0558  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.13 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0661  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.56 
 
 		 356 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1043  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.14 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2032  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.52 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000277554  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0768  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.29 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1208  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.74 
 
 		 361 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000951644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3203  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.89 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1261  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.58 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1286  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.58 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.510283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0009  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.59 
 
 		 391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.35972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1709  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.5 
 
 		 357 aa  358  7e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3196  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.33 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0368063 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1088  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.49 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4410  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.94 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1942  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.79 
 
 		 389 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230816  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.16 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.162276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1273  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.4 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0120  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.34 
 
 		 380 aa  352  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1867  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.87 
 
 		 354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1250  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.37 
 
 		 372 aa  352  7e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0156  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.49 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.983052  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1771  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.27 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0224697  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0585  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.32 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0152244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2215  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.76 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000311671  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0260  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  47.62 
 
 		 363 aa  349  3e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.734432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0381  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.68 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0390  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.68 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.41 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02880  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.31 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.422195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1858  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.59 
 
 		 373 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3841  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.85 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_984  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  47.5 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3648  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.71 
 
 		 382 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.51 
 
 		 391 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0072  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.51 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.955538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0591  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.58 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0965  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.09 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0738044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0086  carbamoyl phosphate synthase small subunit  44.32 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000481793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.88 
 
 		 381 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.27 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3404  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.83 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.53 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1201  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.94 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.24 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0967  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.95 
 
 		 386 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00370508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1003  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.83 
 
 		 386 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0354323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2194  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  44.74 
 
 		 373 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2940  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.48 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0592  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.65 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3305  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.46 
 
 		 386 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0074  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.24 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1141  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.4 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1011  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.39 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0107  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.7 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1071  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.76 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0749952  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0218  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.2 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00036  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3567  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2370  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.45 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3623  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1051  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.91 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.098868  hitchhiker  0.0000017806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 391 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00035  hypothetical protein  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.65 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0554  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.28 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0033  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.7 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3401  carbamoyl phosphate synthase small subunit  45.91 
 
 		 391 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00720177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0073  carbamoyl phosphate synthase small subunit  46.24 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2083  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.4 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>