More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_656 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_656  ribosomal protein L20  100 
 
 		 119 aa  233  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000283782  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0678  50S ribosomal protein L20  96.12 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000222591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0750  50S ribosomal protein L20  97.09 
 
 		 119 aa  200  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000580025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  52.29 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  55.45 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  49.18 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  50.91 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  51.38 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  52.73 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  50.44 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  50.46 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  51.82 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  55.14 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  51.96 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0726  ribosomal protein L20  53.15 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  49.09 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  51.38 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  49.18 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  49.54 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  54.9 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  48.62 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  54.9 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  50.44 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  49.54 
 
 		 163 aa  120  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  49.56 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  48.62 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  50.45 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  46.79 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  50.98 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  47.71 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  48.7 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  54.46 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  48.67 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 118 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  48.7 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  47.71 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  47.79 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  48.62 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  47.71 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  48.62 
 
 		 128 aa  117  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 119 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  53.77 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  50.98 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  50 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  51.4 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  51.4 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  53.77 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  49.06 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  50.45 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  46.55 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  45.08 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  45.22 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  53.21 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  47.06 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  45.9 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0492  ribosomal protein L20  48.21 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  50.46 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  51.4 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>