More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4178 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0375  argininosuccinate lyase  75.4 
 
 		 445 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4178  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 444 aa  916    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3088  argininosuccinate lyase  62.3 
 
 		 445 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6550  argininosuccinate lyase  60.27 
 
 		 443 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4202  argininosuccinate lyase  58.92 
 
 		 443 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.088708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3427  argininosuccinate lyase  57.44 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0314  argininosuccinate lyase  41.81 
 
 		 448 aa  332  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1625  argininosuccinate lyase  41.33 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1044  argininosuccinate lyase  38.01 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0765305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1068  argininosuccinate lyase  38.01 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000423672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2723  argininosuccinate lyase  38.6 
 
 		 431 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0319  argininosuccinate lyase  37.21 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0061962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00346  argininosuccinate lyase  38.26 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0117743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0289  argininosuccinate lyase  37.44 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000424383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  38.48 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  38.21 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  37.56 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  37.09 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  38.83 
 
 		 465 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  38.46 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  37.31 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  36.32 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  36.25 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  38.64 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  37.91 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  36.71 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  38.36 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  36.62 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  36.62 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  36.2 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  37.5 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  36.46 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  37.66 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  37.66 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  38.48 
 
 		 461 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  37.66 
 
 		 476 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  36.67 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  37.76 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  36.2 
 
 		 458 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0557  argininosuccinate lyase  36.81 
 
 		 411 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  37.34 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  36.11 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  38.81 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 469 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 		 462 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  37.66 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  37.6 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  37.8 
 
 		 472 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  38.16 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  35.9 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  38.54 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 		 463 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  37.5 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  38.81 
 
 		 491 aa  237  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  35.38 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0533  argininosuccinate lyase  36.81 
 
 		 411 aa  236  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  36.52 
 
 		 458 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  36.67 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  36.15 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  36.15 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  36.72 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  35.9 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  36.29 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  37.67 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  36.8 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  37.37 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  36.15 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.36 
 
 		 624 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  38.42 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  37.47 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  36.95 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  35.41 
 
 		 466 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  37.26 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  38.42 
 
 		 464 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  34.78 
 
 		 462 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  35.88 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.36 
 
 		 624 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  36.22 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  37.57 
 
 		 624 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  37.43 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  36.62 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>